Nationella referenslaboratorier för enterovirus (coxsackievirus, echovirus-, övriga enterovirus) och parechovirus
Här finns information om analyser, svarstider, avgifter och uppdragsbeskrivning.
Ansvarigt laboratorium
Medicinsk Diagnostik Karolinska
- Avdelning: Medicinsk enhet Klinisk mikrobiologi
- Verksamhetschef: Annika Tiveljung Lindell
Kompletterande laboratorium
Folkhälsomyndigheten
- Avdelningen för mikrobiologi
- Avdelningschef: Sara Byfors
Omfattning
Coxsackievirus, echovirus, övriga enterovirus och parechovirus.
Fördelning av uppdrag
För frågor kring diagnostik hänvisas till MDK respektive Folkhälsomyndigheten enligt nedanstående förteckning. För övriga frågor kontaktas MDK om det inte är tydligt att frågan hanteras av Folkhälsomyndigheten.
Kontaktuppgifter och tillgänglighet
Medicinsk Diagnostik Karolinska
Referensfunktioner nås genom laboratoriets ordinarie kontaktvägar för läkarkonsultation.
Kontakt med Klinisk Mikrobiologi (karolinska.se)
Ledare av NRL: Jan Albert, professor, överläkare.
Folkhälsomyndigheten
Referensfunktioner nås genom laboratoriets ordinarie kontaktvägar för läkarkonsultation.
Kundtjänst mikrobiologi (folkhalsomyndigheten.se)
Vid brådskande behov utanför kontorstid kan fråga anmälas till KMiB, på telefon 010-205 24 00, för vidareförmedling till NRL med svar under kontorstid.
Ledare av NRL: Lena Dillner, enhetschef.
Referensdiagnostik
| Analys | Tid till utsvar | Avgift |
|---|---|---|
| Primärdiagnostik för enterovirus (inklusive coxsackievirus, echovirus) samt parechovirus med realtids-PCR, ackrediterad analys | 1-4 dagar | 1 349 kr |
| Enterovirus-D68 realtids-PCR, kvalitetssäkrad analys | 1-4 dagar | 1 349 kr |
| Enterovirus/rhinovirustypning med sekvensering, kvalitetssäkrad analys | 1-2 veckor (a) | 0 kr |
(a) 2-4 dagar vid akuta frågeställningar.
| Analys | Ackrediterade | Tid till utsvar | Avgift | Övrigt |
|---|---|---|---|---|
| Fördjupad karaktärisering med ackrediterad typningsmetodik (molekylära metoder) vid verifierad enterovirusinfektion | Alla molekylära metoder är SWEDAC-ackrediterade | 20 arbetsdagar | 0 kr | Typning av enterovirus (enteroviruspositiv meningoencefalit) som ingår i det nationella övervakningsprogrammet för poliovirus är avgiftsfria |
Avgifter enligt avtal 2019-01-01 har uppdaterats 2022-04-29.
Folkhälsomyndigheten svarar ut på papper eller elektroniskt via LabPortalen; till Karolinska, Sahlgrenska, Uppsala, Linköping kopplas E-svar till journalsystemet.
LabPortalen/eRemiss (infosolutions.se)
Referensmaterial
Medicinsk Diagnostik Karolinska
Patientprover, typade patientprover, plasmider för EV-D68 och ytterligare några enterovirustyper. Frysta referensstammar för många enterovirustyper, dock ej fullständigt katalogiserat och underhållet.
Folkhälsomyndigheten
Visst referensmaterial (enterovirusisolat) finns på myndigheten. Vid Folkhälsomyndigheten finns virusodling uppsatt för polio inom övervakningsprogrammet.
Expertstöd
Medicinsk Diagnostik Karolinska
På MDK finns virologisk kompetens på överläkarnivå alltid tillgänglig under laboratoriets öppettider. Vid behov av akut konsultation finns expertkompetens på enterovirus i allmänhet tillgänglig. Expertkompetens garanteras via aktiv forskning och deltagande i europeiska nätverk, fr.a. European Non-Polio Enterovirus Network (ENPEN).
Folkhälsomyndigheten
Folkhälsomyndigheten är delaktig i utbrottshantering med expertkompetens.
Utveckling och samverkan
Medicinsk Diagnostik Karolinska
MDK har tillgång till sekvensering och typning av genregionerna VP1 och VP4/VP2 för enterovirus och rhinovirus. NGS-baserad helgenomsekvensering för enterovirus D68 utförs i samarbete med Clinical Genomics, SciLifeLab och arbete med att etablera helgenomsekvensering av andra typer av enterovirus och rhinovirus pågår.
Folkhälsomyndigheten
Främst inom typningsmetodik, amplicon sekvensering (NGS).
Omvärldsbevakning och beredskap
Medicinsk Diagnostik Karolinska
Se ovan. MDK bedriver omvärldsbevakning som ett led i vårt deltagande i europeiska nätverk och forskning.
Folkhälsomyndigheten
Folkhälsomyndigheten bedriver kontinuerlig omvärldsbevakning som utvärderas och distribueras till nationella intressenter. Myndigheten får också regelbundet tillgång till global information ifrån WHO och ECDC.