Nationellt referenslaboratorium för övriga bakterier riskklass 3 (Brucella, Burkholderia, Coxiella burnetti, Yersinia pestis)
Här finns information om analyser, svarstider, avgifter och uppdragsbeskrivning.
Ansvarigt laboratorium
Folkhälsomyndigheten
- Avdelningen för mikrobiologi
- Avdelningschef: Sara Byfors
Omfattning
Detta NRL inkluderar bakterier riskklass 3 som inte omfattas av annat NRL: Brucella, Burkholderia, Coxiella burnetti, Yersinia pestis.
Kontaktuppgifter och tillgänglighet
Referensfunktioner nås genom laboratoriets ordinarie kontaktvägar för läkarkonsultation.
Kundtjänst mikrobiologi (folkhalsomyndigheten.se)
Vid brådskande behov utanför kontorstid kan fråga anmälas till KMiB, på telefon 010-205 24 00, för vidareförmedling till NRL med svar under kontorstid.
Ledare av NRL: Ryan Terrey, leg. biomedicinsk analytiker.
Referensdiagnostik
| Analys | Svarstid | Avgift |
|---|---|---|
| Brucella spp (odling och nukleinsyrepåvisning) (f) | 1-14 dagar (a) | 3 610 kr |
| Brucella spp, antikroppspåvisning (IgG och IgM ELISA) | Inom 7 arbetsdagar efter ankomst till laboratoriet (b) | 1 165 kr |
| Burkholderia mallei resp pseudomallei (odling och nukleinsyrepåvisning) (f) | 1-7 dagar (c) | 4 340 kr |
| Burkholderia mallei/pseudomallei, IgG/IgM (MIF) | Inom 10 arbetsdagar efter ankomst till laboratoriet (b) | 1 925 kr |
| Coxiella burnetii (nukleinsyrepåvisning) (f) | Inom 1-5 arbetsdagar efter ankomst till laboratoriet (b) | 3 030 kr |
| Coxiella burnetii, antikroppspåvisning (IgG och IgM ELISA) | Inom 10 arbetsdagar efter ankomst till laboratoriet (b) | 1 265 kr |
| Coxiella burnetii, IgG/IgM (MIF) | Inom 10 arbetsdagar efter ankomst till laboratoriet (b) | 1 925 kr |
| Yersinia pestis (odling och nukleinsyrepåvisning) (f) | 1-3 dagar (d) | 5 400 kr |
| Riskklass 3 bakterier, resistensbestämning (e) | Inom 7 arbetsdagar efter ankomst till laboratoriet (b) | 5 560 kr |
(a) PCR utförs samma dag som prov ankommer till Folkhälsomyndigheten och svaras ut direkt. Negativa prov odlas i 14 dagar med upprepade PCR innan slutsvar.
(b) Telefonsvar kan i regel ges samma dag alternativt två dagar efter att analysen körs men att sjukdomskinetiken kan göra att konklusivt svar avseende infektion kräver kompletterande analyser och/eller prov.
(c) PCR utförs samma dag som prov ankommer till Folkhälsomyndigheten och svaras ut direkt. Negativa prov odlas i 7 dagar med upprepade PCR samt MALDI-TOF på eventuella positiva kolonier innan slutsvar.
(d) PCR utförs samma dag som prov ankommer till Folkhälsomyndigheten och svaras ut direkt. Negativa prov odlas i 2 dagar med upprepade PCR samt MALDI-TOF på eventuella positiva kolonier innan slutsvar.
(e) MIC-bestämning utförs med mikrobuljongspädning.
(f) Om 16s-sekvensering önskas för påvisning av andra smittämnen än specificerade riskklass 3-bakterier kan denna analys utföras som komplement till art- och genusspecifika PCR-analyser. Avgiften är 1 720 kr, se Prislista för laboratorieanalyser
Utöver ovan avgifter tillkommer beroende på situation nedan avgifter.
|
Analys |
Avgift |
|---|---|
|
Konfirmerande analys, sekvensering riskklass 3 |
4 800 kr |
Analyserna kan utföras samtliga helgfria vardagar året runt.
Avgifter enligt avtal 2019-02-01 har uppdaterats 2022-04-29. Dessa kan årligen höjas motsvarande landstingsindex/konsumentprisindex (LPI/KPI), eller vid behov högre efter förankring i SLIM styrgrupp.
Folkhälsomyndigheten svarar ut på papper eller elektroniskt via LabPortalen.
LabPortalen/eRemiss (infosolutions.se)
Referensmaterial
Myndigheten bedömer att denna typ av fåtalsdiagnostik i möjligaste mån ur ett kvalitets- och säkerhetsperspektiv ska centraliseras till ett laboratorium för klinisk mikrobiologisk diagnostik.
Expertstöd
Folkhälsomyndigheten ger expertstöd och rådgivning ger vid utredningar där misstanke om högpatogena icke-toxinproducerande bakterier. Denna rådgivning finns tillgänglig på telefon 7/24/365 genom funktionen Klinisk mikrobiolog i beredskap.
Utveckling och samverkan
Verksamheten utvecklar och validerar nya metoder vid behov själva eller i samverkan med andra internationella laboratorier. Den omfattande omvärldsbevakning som finns vid myndigheten ligger till grund för beslut om etablering av nya diagnostiska metoder Se punkt 9 för vilka nätverk verksamheten samverkar med.
Omvärldsbevakning och beredskap
Folkhälsomyndigheten får via sitt IHR uppdrag tidigt ta del av en rad olika internationella utbrottsvarningar (t.ex. EWRS, ECDC- och WHO kommunikation). Verksamhetschefen är dessutom national microbiological focal point för ECDC och myndigheten får dagliga uppdateringar från ECDC om aktuella internationella smittskyddsrelevanta händelser. Myndigheten deltar också i det svenska respektive nordiska Forum för Beredskapsdiagnostik och det europeiska nätverket EMERGE som koordineras från Roberth Koch Institutet i Tyskland. I dessa nätverk omfattas metodutveckling, övningar och arbete med kvalitetssäkring för diagnostik av högpatogena bakterier.
Myndigheten har också genom sitt samordningsansvar gentemot landets smittskydd löpande kontakt med landets samtliga smittskyddsenheter och får på regelbundna veckomöten eller via mejl information om aktuella smittskyddshändelser runt om i landet. En systematisk litteratur och mediabevakning finns på myndigheten som genom mejluppdateringar och dagliga 11-möten förmedlas till den laborativa verksamheten.