Nationella referenslaboratorier för hantavirus
Här finns information om analyser, svarstider, avgifter och uppdragsbeskrivning.
Ansvarigt laboratorium
Norrlands Universitetssjukhus
- Avdelning: Klinisk mikrobiologi
- Verksamhetschef: Ewa Lassén
Kompletterande laboratorium
Folkhälsomyndigheten
- Avdelningen för mikrobiologi
- Avdelningschef Sara Byfors
Fördelning av uppdrag
Vid frågor kontaktas ansvarigt NRL, om det inte är tydligt att frågan hanterades av kompletterande NRL.
Kontaktuppgifter och tillgänglighet
Norrlands Universitetssjukhus
Kontakt med läkare nås via sjukhusets växel 090-785 00 00 och på dagtid även via mikrobiologens sekreterare 090-785 11 25. Klinisk bakteriolog finns tillgänglig klockan 8:00-21:00 och klinisk virolog dygnet runt. Vid behov förmedlar jourläkare kontakt med expert relevant för frågeställningen senast påföljande vardag.
Ej brådskande frågor av till exempel metodologisk eller teoretisk natur kan mailas till NRL ledare.
Ledare av NRL: Lisa Pettersson, specialistläkare klinisk virologi och klinisk mikrobiologi.
lisa.pettersson@regionvasterbotten.se
Folkhälsomyndigheten
Referensfunktioner nås genom laboratoriets ordinarie kontaktvägar för läkarkonsultation.
Kundtjänst mikrobiologi (folkhalsomyndigheten.se)
Vid brådskande behov utanför kontorstid kan fråga anmälas till KMiB, på telefon 010-205 24 00, för vidareförmedling till NRL med svar under kontorstid.
Ledare av NRL: Klara Sondén, infektionsläkare.
Referensdiagnostik
Norrlands Universitetssjukhus
Vi kommer att bistå med rådgivning om provtagning och val av analys. Vi utför serologi på det stora flertalet prover som kommer till oss och som komplement utför vi även PCR-analys. PCR analys utförs till exempel hos patienter som har antikroppsbrist och därför kan bli negativa i serologin samt hos svårt sjuka patienter då det finns indikation på att ett högt antal RNA-kopior i serum kan tala för en sämre prognos. PCR-analys kan även vara av värde för att ställa diagnos om patienten nyss har insjuknat och inte har hunnit utveckla antikroppar ännu.
| Analys | Svartid | Avgift |
|---|---|---|
| Puumalavirus, serologi: ELISA med påvisande av IgG | (a) | 691,20 kr |
| Puumalavirus, serologi: ELISA med påvisande av IgM | (a) | 691,20 kr |
| Puumalavirus, kommersiellt snabbtest för påvisande av IgM antikroppar (ReascanTM) | (a) | 648,00 kr |
| Puumalavirus, PCR-analys | (a) | 1101,60 kr |
(a) Analyser utförs nästan varje vardag under högsäsong/epidemi och något glesare med prioritering efter behov övrig tid. Analysresultat och bedömning förmedlas skriftligt och vid behov även via telefon.
Avgifter enligt avtal 2019-01-01 har uppdaterat 2022-04-29. Dessa kan årligen höjas motsvarande landstingsindex/ konsumentprisindex (LPI/KPI), eller vid behov högre efter förankring i SLIM styrgrupp.
Folkhälsomyndigheten
| Analys | Tillgänglighet | Maximal tid till utsvar | Avgift |
|---|---|---|---|
| Andesvirus (nukleinsyrapåvisning) (ingår i 7/24-beredskapsdiagnostiken) | Analysen utförs dygnet runt alla dagar året runt mot särskild akuttaxa | Preliminärsvar ges inom ca 12 h efter provets ankomst | 1 995 kr |
| Dobravavirus IgM (snabbtest) | Analysen kan utföras samtliga helgfria vardagar året runt | Inom 3 arbetsdagar efter ankomst till laboratoriet | 670 kr |
| Hantaanvirus serologi (IF) | Analysen kan utföras samtliga helgfria vardagar året runt | Inom 7 arbetsdagar efter ankomst till laboratoriet | 1 155 kr |
| Hantavirus neutraliserande antikroppar (NT) för Seoul-, Hantaan-, Puumala-, Dobrava-, Saarema-, Andes-, Sin Nombre- och Tula-virus | Analysen kan påbörjas inom 2 veckor efter prov ankommit | Inom 28 dagar | 3 300 kr |
| Puumalavirus IgM (snabbtest) | Analysen kan utföras samtliga helgfria vardagar året runt | Inom 3 arbetsdagar efter ankomst till laboratoriet | 730 kr |
| Puumalavirus (nukleinsyrepåvisning), svenska stammar | Analysen kan utföras samtliga helgfria vardagar året runt | Inom 3 arbetsdagar efter ankomst till laboratorie | 2 160 kr |
| Puumalavirus serologi (IF) | Analysen kan utföras samtliga helgfria vardagar året runt | Inom 7 arbetsdagar efter ankomst till laboratoriet | 1 255 kr |
| Sin Nombrevirus (nukleinsyrapåvisning) | Analysen kan utföras samtliga helgfria vardagar året runt | Preliminärsvar ges inom ca 12 h efter provets ankomst | 2 160 kr |
Avgifter enligt avtal 2019-01-01 har uppdaterats 2022-04-29. Dessa kan årligen höjas motsvarande landstingsindex/ konsumentprisindex (LPI/KPI), eller vid behov högre efter förankring i SLIM styrgrupp.
Folkhälsomyndigheten svarar ut på papper eller elektroniskt via: LabPortalen/eRemiss (infosolutions.se)
Referensmaterial
Norrlands Universitetssjukhus
Laboratoriet kommer vid behov att bistå med kontrollmaterial (antigen eller kontrollsera) för metodutveckling och validering när så efterfrågas.
Folkhälsomyndigheten
Folkhälsomyndigheten kommer i mån av möjlighet och behov att bistå med kontrollmaterial (RNA och antigen, inte kontrollsera) för metodutveckling och validering när så efterfrågas. Laboratoriet kan också vara del i metodutvärdering mellan flera olika laboratorier. Vår ansökan utgår från fåtalsdiagnostik och eftersom vi utifrån ett kvalitetsperspektiv ser det som ändamålsenligt att icke inhemska hantavirusfrågeställningar prover centraliseras till ett NRL bedömer vi det inte aktuellt att skicka ut paneler för dessa.
Expertstöd
Norrlands Universitetssjukhus
Vi kommer att tillhandahålla kvalificerat stöd vid frågor om diagnostik och utredning av patient med misstänkt infektion, hantering vid utbrott och vid behov av back-up, rådgivning till laboratorier vid etablering, validering och kvalitetssäkring av tester.
Folkhälsomyndigheten
Folkhälsomyndigheten ger expertstöd och rådgivning till behandlande läkare och laboratorier angående utredningar av patienter där misstanke om hantavirusinfektion och dess differentialdiagnoser föreligger.
Utveckling och samverkan
Norrlands Universitetssjukhus
Verksamheten utvecklar och validerar nya metoder vid behov själva eller i samverkan med andra laboratorier. Till exempel har vi samverkat med Jonas Klingström forskare på Folkhälsomyndigheten och Karolinska Institutet. Under 2022 planeras genomförande av projektet ”Utveckling av modern sekvenseringsteknologi för diagnostik och epidemiologisk övervakning av Puumalavirus och andra orthohantavirus” med syfte att utveckla ett protokoll för karaktärisering av för orthohantavirus generellt och PUUV i synnerhet med modern sekvenseringsteknologi, sk. Next generation sequencing. Metoden skall kunna användas för diagnostik så väl som molekylärepidemiologisk övervakning. Projektet är ett samarbete mellan de två Nationella referenslaboratorierna (NRL) för hantavirus, Umeå universitet och Totalförsvarets forskningsinstitut (FOI).
Från Umeå universitet medverkar Dr. Anne Tuiskunen Bäck, läkare och associerad till Umeå universitet. Från huvudansvarigt NRL för hantavirus vid Norrlands universitetssjukhus medverkar Dr. Lisa Pettersson, specialistläkare inom klinisk virologi och ledare för nationellt referenslaboratorium. Från kompletterande NRL för Hantavirus medverkar professor Jonas Klingström och specialistläkare Klara Sondén, Från FOI medverkar Dr. Andreas Sjödin, -laborerande personal på FOI.
Folkhälsomyndigheten
Verksamheten utvecklar och validerar nya metoder vid behov själva eller i samverkan med andra laboratorier, se ovan. Den omfattande omvärldsbevakning som finns vid myndigheten ligger till grund för beslut om etablering av nya diagnostiska metoder.
Omvärldsbevakning och beredskap
Norrlands Universitetssjukhus
Tätt samarbete med Smittskyddsenheten och Folkhälsomyndigheten. Vi har jourberedskap 24 timmar om dygnet med möjlighet att utföra snabbtest för Puumalavirus IgM och vanlig serologi. Vi har även möjlighet att utföra PCR-analys dagtid på helger och laboratoriets öppettider planeras att förlängas. Kontorstid utför vi i princip dagligen serologi och PCR i rutindiagnostiken.
Folkhälsomyndigheten
Folkhälsomyndigheten får via sitt IHR uppdrag tidigt ta del av en rad olika internationella utbrottsvarningar (t.ex. EWRS, ECDC- och WHO kommunikation). Verksamhetschefen är dessutom national microbiological focal point för ECDC och myndigheten får dagliga uppdateringar från ECDC om aktuella internationella smittskyddsrelevanta händelser. Myndigheten har också tillgång till information om förändringar i förekomst av Puumalavirus över hela Sverige via systemet för rapportering av anmälningspliktiga sjukdomar (SmiNet).